Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF558Q96NG5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms