Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF488Q96MN9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms