Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NSMCE3Q96MG7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE3Q96MG7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms