Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
LINC00208Q96KT6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00208Q96KT6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms