Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHACTR3Q96KR7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms