Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ4

MSLNL, Mesothelin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNLQ96KJ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSLNLQ96KJ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms