Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms