Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG1Q96JA1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG1Q96JA1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms