Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms