Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A3Q96HJ5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms