Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ACSBG1Q96GR2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms