Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TVP23CQ96ET8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms