Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf8Q96DM3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C18orf8Q96DM3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms