Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ULK4Q96C45 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK4Q96C45 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms