Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC127Q96BQ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC127Q96BQ5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms