Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLUAP1Q96AJ1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLUAP1Q96AJ1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLUAP1Q96AJ1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms