Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms