Protein–RNA interactions for Protein: Q92565

RAPGEF5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF5Q92565 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAPGEF5Q92565 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAPGEF5Q92565 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms