Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD6Q92537 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms