Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYR4

RSPH1, Radial spoke head 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH1Q8WYR4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH1Q8WYR4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPH1Q8WYR4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms