Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf54Q8WWF1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
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