Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms