Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms