Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LINC00116Q8NCU8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms