Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC197Q8NCU1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms