Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF169Q8NCN4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF169Q8NCN4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms