Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APCDD1LQ8NCL9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APCDD1LQ8NCL9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms