Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
PRPF38AQ8NAV1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF38AQ8NAV1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms