Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms