Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSIP1Q8NA03 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms