Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM71DQ8N9W8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71DQ8N9W8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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