Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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CLDN19Q8N6F1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN19Q8N6F1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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