Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC43Q8N309 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms