Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00518Q8N0U6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms