Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms