Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD4Q8IYR2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD4Q8IYR2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms