Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM139Q8IV31 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms