Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC36■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PBRM1Q86U86 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms