Protein–RNA interactions for Protein: Q86U02

LINC00596, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00596, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00596Q86U02 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00596Q86U02 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00596Q86U02 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms