Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC46A3Q7Z3Q1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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