Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM15Q7Z3B0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM15Q7Z3B0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms