Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms