Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT2Q7L5N7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms