Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HECW1Q76N89 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC34■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HECW1Q76N89 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HECW1Q76N89 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms