Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 308.6 ms