Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00299Q6ZSB3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms