Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM136Q6ZRR5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms