Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNT2Q6UVM3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNT2Q6UVM3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms