Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSSK4Q6SA08 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms