Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC23A3Q6PIS1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms